Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBDO15205 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBDO15205 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms