Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCSO14618 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCSO14618 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCSO14618 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCSO14618 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCSO14618 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCSO14618 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCSO14618 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCSO14618 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCSO14618 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCSO14618 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCSO14618 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCSO14618 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCSO14618 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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