Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms