Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms