Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A3GALT2U3KPV4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms