Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms