Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF24Q9UPV7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF24Q9UPV7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms