Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX14

NDUFB11, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB11Q9NX14 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms