Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMC2Q9NRP2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMC2Q9NRP2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms