Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms