Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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SEC22CQ9BRL7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SEC22CQ9BRL7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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