Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms