Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms