Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms