Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN22Q8N7P3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN22Q8N7P3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN22Q8N7P3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms