Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC29A4Q7RTT9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms