Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBLN3Q6UW01 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms