Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3EQ6PEY2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms