Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms