Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BRMS1LQ5PSV4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms