Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms