Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms