Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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NEDD8Q15843 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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NEDD8Q15843 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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NEDD8Q15843 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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NEDD8Q15843 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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NEDD8Q15843 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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NEDD8Q15843 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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NEDD8Q15843 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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