Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms