Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms