Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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