Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms