Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.213e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CYB561-221ENST00000585153 811 ntTSL 316.3■□□□□ 0.27e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF74-208ENST00000493734 3758 ntTSL 216.23■□□□□ 0.193e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.177e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SFXN2-203ENST00000480358 2315 ntTSL 516.1■□□□□ 0.173e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.163e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.153e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SUGP1-212ENST00000591007 1377 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.123e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SFXN2-202ENST00000459894 2324 ntTSL 215.6■□□□□ 0.093e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ESRRB-208ENST00000611036 2190 nt15.54■□□□□ 0.087e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BCS1L-218ENST00000477422 915 ntTSL 215.44■□□□□ 0.062e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.043e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 TSPAN31-211ENST00000550791 2118 ntTSL 215.26■□□□□ 0.033e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.023e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 547 ntTSL 515.03■□□□□ -03e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.013e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.023e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 MAF1-202ENST00000527058 868 ntTSL 314.85□□□□□ -0.036e-14■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF74-206ENST00000437275 3744 ntTSL 1 (best)14.8□□□□□ -0.043e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 TSPAN31-203ENST00000546993 2026 ntTSL 214.73□□□□□ -0.053e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 STYXL1-205ENST00000430497 651 ntTSL 1 (best)14.71□□□□□ -0.053e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 STYXL1-207ENST00000438695 764 ntTSL 1 (best)14.71□□□□□ -0.053e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SUGP1-214ENST00000592188 2029 ntTSL 214.68□□□□□ -0.063e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BCS1L-215ENST00000460579 985 ntTSL 314.6□□□□□ -0.072e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.087e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BRD1-204ENST00000438393 3051 ntTSL 214.44□□□□□ -0.17e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 VPS52-220ENST00000493674 878 ntTSL 214.43□□□□□ -0.13e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.13e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CINP-206ENST00000559504 1781 ntTSL 1 (best)14.23□□□□□ -0.132e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 STYXL1-206ENST00000431581 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PRMT2-213ENST00000486520 4031 ntTSL 214.1□□□□□ -0.153e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.176e-14■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.183e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PROSER2-AS1-201ENST00000445498 3146 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.187e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.183e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 TMED9-206ENST00000513799 772 ntTSL 213.92□□□□□ -0.182e-24■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SPOP-205ENST00000503676 1932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.196e-14■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF394-204ENST00000462024 528 ntTSL 313.85□□□□□ -0.193e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.213e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BCS1L-207ENST00000426649 660 ntTSL 213.7□□□□□ -0.222e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 AC109446.3-201ENST00000567344 641 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.233e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.243e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.257e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.253e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CEP192-212ENST00000540847 2485 ntTSL 213.44□□□□□ -0.263e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 HMGCL-202ENST00000374487 2151 ntTSL 213.35□□□□□ -0.273e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BCS1L-216ENST00000465706 526 ntTSL 513.29□□□□□ -0.282e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RBP5-201ENST00000266560 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.286e-14■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SGF29-204ENST00000565945 535 ntTSL 213.28□□□□□ -0.283e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 HMGCL-204ENST00000436439 1354 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.323e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BRD1-203ENST00000404760 4550 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.337e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 WDR74-214ENST00000543688 537 ntTSL 313.01□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.333e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RBM7-203ENST00000540163 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.343e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CINP-201ENST00000216756 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.352e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RC3H2-210ENST00000498479 5746 ntTSL 212.87□□□□□ -0.357e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 TRAK1-202ENST00000341421 4620 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.363e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.393e-6■■■□□ 15.2
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PABPC4Q13310 PTGES3L-AARSD1-203ENST00000409399 2042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.47e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 STYXL1-202ENST00000340062 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.413e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RC3H2-202ENST00000357244 3991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.417e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CINP-202ENST00000536961 845 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.412e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SPOP-202ENST00000393328 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.436e-14■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF300-205ENST00000446148 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.457e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 AC073861.1-201ENST00000496294 459 ntBASIC12.24□□□□□ -0.452e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ARMC1-201ENST00000276569 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.473e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 VPS52-217ENST00000478934 2602 ntTSL 211.96□□□□□ -0.53e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RBM7-205ENST00000542140 1908 ntTSL 1 (best)11.95□□□□□ -0.53e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 THEM4-202ENST00000471464 1832 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.513e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 HMGCL-201ENST00000235958 1101 ntTSL 511.86□□□□□ -0.513e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CEP192-210ENST00000513183 703 ntTSL 311.64□□□□□ -0.553e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CINP-203ENST00000541568 572 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.552e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PCNT-205ENST00000480896 10485 ntTSL 1 (best)11.44□□□□□ -0.583e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF300-201ENST00000274599 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.67e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 AARSD1-211ENST00000486493 399 ntTSL 211.24□□□□□ -0.617e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.623e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SFXN2-201ENST00000369893 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.633e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CINP-207ENST00000559514 4270 ntTSL 211.04□□□□□ -0.642e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RBM7-209ENST00000624815 3587 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.663e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF300-202ENST00000394226 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.667e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SLC30A5-205ENST00000507354 2310 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.673e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BLOC1S6-201ENST00000220531 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.693e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 BLOC1S6-218ENST00000568816 4013 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.723e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 DPAGT1-205ENST00000442480 999 ntTSL 510.53□□□□□ -0.723e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SGF29-202ENST00000564023 354 ntTSL 510.52□□□□□ -0.733e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 MRPS18C-206ENST00000509571 442 ntTSL 310.5□□□□□ -0.733e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 KLHL12-202ENST00000367259 2257 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.743e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SLC9A6-207ENST00000636092 4697 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.753e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 TSPAN31-206ENST00000547992 3434 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.763e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SLC9A6-209ENST00000636347 4867 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.773e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RPL7L1-205ENST00000483998 1103 ntTSL 510.19□□□□□ -0.782e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RBM7-204ENST00000541475 6725 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.783e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 DNAJC12-203ENST00000480180 590 ntTSL 310.07□□□□□ -0.83e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.813e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 KMT5B-209ENST00000441488 2816 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.853e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.867e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RC3H2-206ENST00000454740 923 ntTSL 59.66□□□□□ -0.867e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 COQ3-202ENST00000369240 646 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.873e-6■■■□□ 15.2
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 169.3 ms