Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RESTQ13127 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RESTQ13127 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RESTQ13127 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RESTQ13127 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RESTQ13127 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RESTQ13127 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RESTQ13127 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms