Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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FOXD4Q12950 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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