Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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