Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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