Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMX1Q04741 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms