Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN7AQ01118 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN7AQ01118 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms