Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID4AP29374 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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