Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB2P26583 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB2P26583 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB2P26583 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB2P26583 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB2P26583 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB2P26583 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB2P26583 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB2P26583 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB2P26583 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB2P26583 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB2P26583 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB2P26583 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMGB2P26583 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms