Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms