Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms