Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAV1P15498 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAV1P15498 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAV1P15498 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAV1P15498 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms