Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM27P14373 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms