Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RRP8O43159 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RRP8O43159 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RRP8O43159 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RRP8O43159 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RRP8O43159 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RRP8O43159 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RRP8O43159 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RRP8O43159 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RRP8O43159 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RRP8O43159 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RRP8O43159 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RRP8O43159 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RRP8O43159 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RRP8O43159 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RRP8O43159 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RRP8O43159 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RRP8O43159 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RRP8O43159 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RRP8O43159 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RRP8O43159 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RRP8O43159 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RRP8O43159 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RRP8O43159 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RRP8O43159 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RRP8O43159 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RRP8O43159 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RRP8O43159 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RRP8O43159 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RRP8O43159 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms