Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM6BO15054 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM6BO15054 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms