Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATL2C9JE40 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms