Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MAP3K4Q9Y6R4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms