Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms