Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms