Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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RAB23Q9ULC3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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RAB23Q9ULC3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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RAB23Q9ULC3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB23Q9ULC3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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