Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms