Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGA1Q9UJY5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms