Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP2BPQ9P2M1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms